გენადი პაპუნიძემ 1989 წელს დაამთავრა საქართველოს პოლიტექნიკური ინსტიტუტის სამოქალაქო და სამრეწველო მშენებლობის ფაკულტეტი.

1982 – 1991 წლებში იგი მუშაობდა მუშად საქართველოს მშენებლობის სამინისტროს №5 სამშენებლო ტრესტის მოპირკეთების სამმართველოში.

1991 წლიდან გ. პაპუნიძე მუშაობს სამშენებლო კომპანია „ანაგში“; 2011 წლამდე იყო მშენებელი-ოსტატი, ხოლო 2012 წლიდან არის „ანაგის“ სამუშაოთა მწარმოებელი.